Você recebe uma mensagem criptografada de um grupo misterioso de hackers. Eles explicam que, para corrigir o bug, você deve encontrar blocos específicos do código espalhados pela Matrix. Cada bloco está representado como uma peça de um quebra-cabeça.
Caso você consiga resolver o problema, você avança para o próximo desafio, caso não consiga você recebe dicas e pode tentar novamente.